Удалять файлы вручную очень муторно и долго, поэтому в голову пришла мысль написать специальный скрипт, а вернее два. Итак, создаем в папке, где нужно рекурсивно удалить файлы SVN следующие 2 файла: here.bat и clear_svn.bat. 

Содержимое файла here.bat
1.
cmd 
Содержимое файла clear_svn.bat:
1.
for /d /r "%1" %%d in (.svn) do @if exist "%%d" rd /s/q "%%d" pause 

Файл here.bat нужен для открытия CMD в текущем каталоге (чтобы не писать длинную команду CD). Запускаем его и в коммандной строке набираем: 
1.
clear_svn . 
После того, как скрипт отработает радостно замечаем, что все скрытые папки .svn удалены!